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中国农业科学院生物所绘制水稻根组织单细胞图谱[2020-12-30 20:13]

近来,中国农业科学院生物技术研讨所谷晓峰团队和合作者制作了单子叶形式植物水稻首个根安排电子游戏厅下载单细胞分辨率转录组图谱,为研讨植物细胞类型特化、功用和进化供给了新的途径。相关成果宣布在世界学术期刊《分子植物(Molecular Plant)》上。     在植物整个生命过程中,根尖在不断地分解发育,构成的根系从土壤中吸收水分和矿质元素,参加植物与生物或非生物信号的互作,并起到固定植株的效果。可是,植物根系的发育及与环境互作的分子机制还知之甚少。研讨人员对两个水稻培养亚种粳稻Nip(Oryza sativa L. japonica. cv. Nipponbare, geng)和籼稻93-11(Oryza sativa L. indica. cv. 93-11, xian)10,968和12,564个根尖细胞进行了单细胞转录组测序和剖析,判定出8个细胞型。对Nip和93-11每种细胞型差异表达基因进行功用富集剖析,发现大多数基因与环境呼应有关,不同水稻亚种在遭到外部环境影响时呼应机制存在差异。     研讨人员随后对水稻单细胞数据进行拟时剖析,制作了根最外层细胞的发育轨道,来自两个培养品种的单细胞轨道显现高度一致的拟时次序,标明不同亚种之间发育轨道的保存性。进一步结合已宣布的双子叶形式植物拟南芥根尖单细胞转录组数据集进行了比照剖析,这是初次在单细胞水平进行植物安排器官进化剖析,发现拟南芥和水稻大部分细胞类型转录组之间差异较大,只要根毛细胞相关性较高,从而从单细胞水平上阐释了单/双子叶植物根系类型分解的遗传根底。     生物所谷晓峰研讨员和德国海德堡大学Jan U. Lohmann为论文通讯作者,该作业得到了国家严重专项、央级公益性科研院所根本科研业务费、中国农科院科技立异工程项目赞助。     原文链接:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1674205220304457 日期:2020-12-30  
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